Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF3BA8MYP8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms