Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms