Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0D9SFI3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0D9SFI3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0D9SFI3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0D9SFI3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms