Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A3GALT2U3KPV4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A3GALT2U3KPV4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A3GALT2U3KPV4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A3GALT2U3KPV4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms