Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARFGEF1Q9Y6D6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARFGEF1Q9Y6D6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARFGEF1Q9Y6D6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARFGEF1Q9Y6D6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARFGEF1Q9Y6D6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ARFGEF1Q9Y6D6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARFGEF1Q9Y6D6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARFGEF1Q9Y6D6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.73
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ARFGEF1Q9Y6D6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ARFGEF1Q9Y6D6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ARFGEF1Q9Y6D6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms