Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPTNQ9Y664 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPTNQ9Y664 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPTNQ9Y664 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPTNQ9Y664 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPTNQ9Y664 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPTNQ9Y664 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPTNQ9Y664 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KPTNQ9Y664 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KPTNQ9Y664 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KPTNQ9Y664 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms