Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR2E3Q9Y5X4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NR2E3Q9Y5X4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NR2E3Q9Y5X4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NR2E3Q9Y5X4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NR2E3Q9Y5X4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms