Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRRAPQ9Y4A5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRRAPQ9Y4A5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRRAPQ9Y4A5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRRAPQ9Y4A5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRRAPQ9Y4A5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRRAPQ9Y4A5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRRAPQ9Y4A5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRRAPQ9Y4A5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRRAPQ9Y4A5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRRAPQ9Y4A5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRRAPQ9Y4A5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRRAPQ9Y4A5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms