Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R2

PTPN22, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 22, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22Q9Y2R2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN22Q9Y2R2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN22Q9Y2R2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPN22Q9Y2R2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPN22Q9Y2R2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPN22Q9Y2R2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN22Q9Y2R2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN22Q9Y2R2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN22Q9Y2R2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN22Q9Y2R2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPN22Q9Y2R2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN22Q9Y2R2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN22Q9Y2R2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPN22Q9Y2R2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPN22Q9Y2R2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms