Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SETD1BQ9UPS6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SETD1BQ9UPS6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SETD1BQ9UPS6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SETD1BQ9UPS6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SETD1BQ9UPS6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SETD1BQ9UPS6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SETD1BQ9UPS6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SETD1BQ9UPS6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SETD1BQ9UPS6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SETD1BQ9UPS6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SETD1BQ9UPS6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SETD1BQ9UPS6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SETD1BQ9UPS6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SETD1BQ9UPS6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SETD1BQ9UPS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SETD1BQ9UPS6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SETD1BQ9UPS6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SETD1BQ9UPS6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SETD1BQ9UPS6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SETD1BQ9UPS6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SETD1BQ9UPS6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SETD1BQ9UPS6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SETD1BQ9UPS6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SETD1BQ9UPS6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SETD1BQ9UPS6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SETD1BQ9UPS6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
SETD1BQ9UPS6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms