Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPA5

BSN, Protein bassoon, humanhuman

Predictions only

Length 3,926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSNQ9UPA5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BSNQ9UPA5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BSNQ9UPA5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BSNQ9UPA5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BSNQ9UPA5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BSNQ9UPA5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BSNQ9UPA5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BSNQ9UPA5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms