Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM21

MGAT4A, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4AQ9UM21 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MGAT4AQ9UM21 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MGAT4AQ9UM21 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MGAT4AQ9UM21 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4AQ9UM21 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MGAT4AQ9UM21 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MGAT4AQ9UM21 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MGAT4AQ9UM21 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MGAT4AQ9UM21 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MGAT4AQ9UM21 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms