Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL25

RAB21, Ras-related protein Rab-21, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB21Q9UL25 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB21Q9UL25 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB21Q9UL25 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB21Q9UL25 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB21Q9UL25 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB21Q9UL25 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB21Q9UL25 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB21Q9UL25 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB21Q9UL25 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB21Q9UL25 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB21Q9UL25 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB21Q9UL25 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB21Q9UL25 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB21Q9UL25 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms