Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C4Q9UKN8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GTF3C4Q9UKN8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
GTF3C4Q9UKN8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C4Q9UKN8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms