Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HACL1Q9UJ83 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HACL1Q9UJ83 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
HACL1Q9UJ83 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
HACL1Q9UJ83 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
HACL1Q9UJ83 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HACL1Q9UJ83 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms