Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SCN11AQ9UI33 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCN11AQ9UI33 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCN11AQ9UI33 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCN11AQ9UI33 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCN11AQ9UI33 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCN11AQ9UI33 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SCN11AQ9UI33 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCN11AQ9UI33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCN11AQ9UI33 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCN11AQ9UI33 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCN11AQ9UI33 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCN11AQ9UI33 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SCN11AQ9UI33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCN11AQ9UI33 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCN11AQ9UI33 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCN11AQ9UI33 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms