Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFRSF10DQ9UBN6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF10DQ9UBN6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF10DQ9UBN6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF10DQ9UBN6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF10DQ9UBN6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms