Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC4Q9UBN4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC4Q9UBN4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPC4Q9UBN4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms