Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLKQ9UBE8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLKQ9UBE8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NLKQ9UBE8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLKQ9UBE8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms