Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GCNT4Q9P109 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GCNT4Q9P109 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GCNT4Q9P109 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCNT4Q9P109 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNT4Q9P109 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.5 ms