Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HACD3Q9P035 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HACD3Q9P035 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HACD3Q9P035 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms