Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.676e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 TOP1MT-206ENST00000518951 1461 ntTSL 525.36■■□□□ 1.656e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.546e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RMDN3-208ENST00000560460 931 ntTSL 523.95■■□□□ 1.426e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 KISS1R-202ENST00000592648 507 ntTSL 523.91■■□□□ 1.426e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NUBP2-211ENST00000567700 2196 ntTSL 223.84■■□□□ 1.416e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NUBP2-212ENST00000568287 839 ntTSL 523.81■■□□□ 1.46e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RBM6-205ENST00000425608 1886 ntTSL 223.67■■□□□ 1.386e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NUBP2-207ENST00000565603 995 ntTSL 323.65■■□□□ 1.386e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.386e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-211ENST00000527739 582 ntTSL 423.56■■□□□ 1.366e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.366e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NUBP2-215ENST00000568834 1173 ntTSL 223.51■■□□□ 1.356e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 323.45■■□□□ 1.346e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RBM6-202ENST00000419610 2128 ntTSL 223.24■■□□□ 1.316e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.296e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-206ENST00000526966 550 ntTSL 423.03■■□□□ 1.286e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.246e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 ARVCF-207ENST00000473551 2108 ntTSL 222.75■■□□□ 1.236e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RMDN3-211ENST00000560905 1008 ntTSL 222.74■■□□□ 1.236e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.216e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 SYNGR2-205ENST00000589183 796 ntTSL 322.57■■□□□ 1.26e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-237ENST00000485712 474 ntTSL 422.49■■□□□ 1.196e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 TOP1MT-207ENST00000519139 1561 ntTSL 522.45■■□□□ 1.186e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RNF126-204ENST00000590885 1436 ntTSL 522.43■■□□□ 1.186e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 ACAP3-210ENST00000478065 2393 ntTSL 322.26■■□□□ 1.156e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NUBP2-202ENST00000562263 811 ntTSL 322.2■■□□□ 1.146e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.116e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 TALDO1-202ENST00000528070 856 ntTSL 521.96■■□□□ 1.116e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RBM6-209ENST00000441115 1876 ntTSL 221.9■■□□□ 1.16e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.096e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.096e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.096e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.076e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 REEP6-202ENST00000395479 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.73■■□□□ 1.076e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 MFSD12-207ENST00000588626 525 ntTSL 321.73■■□□□ 1.076e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 SLC39A14-212ENST00000524285 570 ntTSL 421.65■■□□□ 1.066e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 ARVCF-209ENST00000487793 863 ntTSL 221.39■■□□□ 1.016e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 SYNGR2-204ENST00000589168 2125 ntTSL 221.35■■□□□ 1.016e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NUBP2-216ENST00000569898 582 ntTSL 321.3■■□□□ 16e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.966e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.956e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 FAM53A-206ENST00000489029 628 ntTSL 321.01■□□□□ 0.956e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.946e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-226ENST00000450424 2658 ntTSL 520.5■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.856e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RNF168-202ENST00000437070 2202 ntTSL 220.17■□□□□ 0.826e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.816e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-208ENST00000413967 2808 ntTSL 220.04■□□□□ 0.86e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.796e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-205ENST00000526954 754 ntTSL 519.9■□□□□ 0.786e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.776e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 SYNGR2-208ENST00000591770 864 ntTSL 219.72■□□□□ 0.756e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RMDN3-207ENST00000558777 2139 ntTSL 219.67■□□□□ 0.746e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.746e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 MFSD12-212ENST00000591878 557 ntTSL 519.59■□□□□ 0.736e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RBM6-220ENST00000493652 581 ntTSL 219.56■□□□□ 0.726e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.696e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.686e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CXXC1-215ENST00000591190 1021 ntTSL 319.26■□□□□ 0.676e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.666e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-210ENST00000421110 2755 ntTSL 519.14■□□□□ 0.656e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.646e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 MFSD12-205ENST00000585814 1002 ntTSL 319.01■□□□□ 0.636e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.596e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CRLF1-202ENST00000593286 514 ntTSL 418.62■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CXXC1-217ENST00000592078 686 ntTSL 218.52■□□□□ 0.566e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.546e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.526e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NUBP2-203ENST00000563136 470 ntTSL 418.25■□□□□ 0.516e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 STK24-207ENST00000491878 547 ntTSL 418.01■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CMIP-206ENST00000565029 1559 ntTSL 1 (best)17.89■□□□□ 0.456e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CXXC1-214ENST00000590901 2562 ntTSL 217.87■□□□□ 0.456e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 PKLR-203ENST00000434082 580 ntTSL 517.61■□□□□ 0.416e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-216ENST00000528739 341 ntTSL 517.43■□□□□ 0.386e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 ARVCF-210ENST00000492625 631 ntTSL 317.38■□□□□ 0.376e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-213ENST00000426123 2907 ntTSL 217.36■□□□□ 0.376e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 EEF1D-240ENST00000531770 589 ntTSL 417.32■□□□□ 0.366e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 ARVCF-205ENST00000462319 433 ntTSL 317.28■□□□□ 0.366e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.366e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 217.24■□□□□ 0.356e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.346e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 MFSD12-213ENST00000592652 486 ntTSL 516.86■□□□□ 0.296e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-227ENST00000455679 542 ntTSL 416.81■□□□□ 0.286e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.266e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.256e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-207ENST00000527189 558 ntTSL 416.36■□□□□ 0.216e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-228ENST00000534373 581 ntTSL 316.36■□□□□ 0.216e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.26e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-227ENST00000533909 573 ntTSL 416.26■□□□□ 0.196e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-215ENST00000528396 571 ntTSL 416.26■□□□□ 0.196e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-209ENST00000527469 584 ntTSL 316.26■□□□□ 0.196e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.156e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.126e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.086e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.026e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.036e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.046e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 EIF4G1-214ENST00000427141 730 ntTSL 514.68□□□□□ -0.066e-6■■■■■ 54.7
AATFQ9NY61 REEP6-203ENST00000395484 611 ntTSL 514.44□□□□□ -0.16e-6■■■■■ 54.7
Retrieved 100 of 5,565 protein–RNA pairs in 152.1 ms