Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FBXO6Q9NRD1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO6Q9NRD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO6Q9NRD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO6Q9NRD1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms