Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPTBN5Q9NRC6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPTBN5Q9NRC6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTBN5Q9NRC6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPTBN5Q9NRC6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTBN5Q9NRC6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 919.4 ms