Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARHGEF3Q9NR81 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF3Q9NR81 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF3Q9NR81 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF3Q9NR81 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGEF3Q9NR81 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms