Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDLIM7Q9NR12 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDLIM7Q9NR12 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDLIM7Q9NR12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDLIM7Q9NR12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDLIM7Q9NR12 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDLIM7Q9NR12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDLIM7Q9NR12 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDLIM7Q9NR12 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDLIM7Q9NR12 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDLIM7Q9NR12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms