Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRDE2Q9H7Z3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRDE2Q9H7Z3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NRDE2Q9H7Z3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRDE2Q9H7Z3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms