Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STN1Q9H668 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STN1Q9H668 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STN1Q9H668 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STN1Q9H668 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms