Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BCL11BQ9C0K0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BCL11BQ9C0K0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.8■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.78■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BCL11BQ9C0K0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BCL11BQ9C0K0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BCL11BQ9C0K0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
BCL11BQ9C0K0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BCL11BQ9C0K0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms