Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFIH1Q9BYX4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFIH1Q9BYX4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFIH1Q9BYX4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFIH1Q9BYX4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFIH1Q9BYX4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms