Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX4Q9BYU1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PBX4Q9BYU1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX4Q9BYU1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBX4Q9BYU1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PBX4Q9BYU1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX4Q9BYU1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX4Q9BYU1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PBX4Q9BYU1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms