Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNS3Q9BQ31 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNS3Q9BQ31 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNS3Q9BQ31 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNS3Q9BQ31 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNS3Q9BQ31 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms