Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMP4Q99727 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMP4Q99727 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TIMP4Q99727 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMP4Q99727 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms