Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYSTQ99698 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LYSTQ99698 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYSTQ99698 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYSTQ99698 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms