Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PIK3R4Q99570 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PIK3R4Q99570 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PIK3R4Q99570 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PIK3R4Q99570 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PIK3R4Q99570 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PIK3R4Q99570 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PIK3R4Q99570 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PIK3R4Q99570 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
PIK3R4Q99570 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PIK3R4Q99570 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PIK3R4Q99570 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PIK3R4Q99570 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PIK3R4Q99570 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PIK3R4Q99570 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
PIK3R4Q99570 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
PIK3R4Q99570 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PIK3R4Q99570 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PIK3R4Q99570 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PIK3R4Q99570 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PIK3R4Q99570 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PIK3R4Q99570 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PIK3R4Q99570 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PIK3R4Q99570 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PIK3R4Q99570 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PIK3R4Q99570 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PIK3R4Q99570 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PIK3R4Q99570 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PIK3R4Q99570 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PIK3R4Q99570 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PIK3R4Q99570 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PIK3R4Q99570 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PIK3R4Q99570 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PIK3R4Q99570 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms