Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF3RQ99062 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF3RQ99062 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF3RQ99062 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms