Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMF1Q96S06 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMF1Q96S06 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMF1Q96S06 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMF1Q96S06 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms