Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC9Q96Q05 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC9Q96Q05 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC9Q96Q05 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC9Q96Q05 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC9Q96Q05 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 455.6 ms