Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNC2Q96PR1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNC2Q96PR1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNC2Q96PR1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNC2Q96PR1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms