Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC42.68■■■■■ 4.42
ARAP1Q96P48 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
ARAP1Q96P48 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
ARAP1Q96P48 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ARAP1Q96P48 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
ARAP1Q96P48 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ARAP1Q96P48 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ARAP1Q96P48 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ARAP1Q96P48 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ARAP1Q96P48 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ARAP1Q96P48 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.42
ARAP1Q96P48 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ARAP1Q96P48 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ARAP1Q96P48 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
ARAP1Q96P48 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ARAP1Q96P48 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
ARAP1Q96P48 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
ARAP1Q96P48 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
ARAP1Q96P48 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
ARAP1Q96P48 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
ARAP1Q96P48 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
ARAP1Q96P48 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
ARAP1Q96P48 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ARAP1Q96P48 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ARAP1Q96P48 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ARAP1Q96P48 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
ARAP1Q96P48 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
ARAP1Q96P48 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ARAP1Q96P48 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARAP1Q96P48 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARAP1Q96P48 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
ARAP1Q96P48 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARAP1Q96P48 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
ARAP1Q96P48 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.34■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
ARAP1Q96P48 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
ARAP1Q96P48 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 489.3 ms