Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCORQ96JN0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LCORQ96JN0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCORQ96JN0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCORQ96JN0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms