Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SHDQ96IW2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SHDQ96IW2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHDQ96IW2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHDQ96IW2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHDQ96IW2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms