Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJA3Q96EY1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJA3Q96EY1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJA3Q96EY1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJA3Q96EY1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms