Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6V1E2Q96A05 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP6V1E2Q96A05 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP6V1E2Q96A05 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1E2Q96A05 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms