Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf43Q8TAL5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9orf43Q8TAL5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C9orf43Q8TAL5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf43Q8TAL5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf43Q8TAL5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms