Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAD8

SNIP1, Smad nuclear-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNIP1Q8TAD8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNIP1Q8TAD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNIP1Q8TAD8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNIP1Q8TAD8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SNIP1Q8TAD8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNIP1Q8TAD8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNIP1Q8TAD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNIP1Q8TAD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNIP1Q8TAD8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNIP1Q8TAD8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNIP1Q8TAD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNIP1Q8TAD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNIP1Q8TAD8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNIP1Q8TAD8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms