Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVIPQ8NHG7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVIPQ8NHG7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVIPQ8NHG7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 862.8 ms