Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMER3Q8N944 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMER3Q8N944 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
AMER3Q8N944 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMER3Q8N944 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms