Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHCHD4Q8N4Q1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHCHD4Q8N4Q1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHCHD4Q8N4Q1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHCHD4Q8N4Q1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHCHD4Q8N4Q1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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