Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00528Q8N1L1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00528Q8N1L1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms